Fakultas Pertanian Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Jawa Timur merupakan salah satu lembaga pendidikan tinggi bidang pertanian di Indonesia yang berdiri sejak 17 Mei 1968.  Selama kurun waktu 45 tahun, UPN “Veteran” Jawa Timur telah mengalami berbagai perubahan status, yaitu;

1. Periode 17 Mei 1968 merupakan tonggak berdirinya Fakultas Pertanian Perguruan Tinggi Pembangunan Nasional (PTPN) “Veteran” Cabang Jawa Timur yang ditandai dengan diterbitkannya Surat Keputusan Kementerian Transmigrasi, Veteran dan Demobilisasi No. 062/Kpts/ Mentransved/68 dan SK Rektor PTPN “Veteran” Yogyakarta.  No. 11/Rek/kpts/ PTPN/68 tanggal 5 September 1968.
2. Periode tahun 1976-1982, PTPN “Veteran” Cabang Jawa Timur berada dibawah naungan langsung Dephankam/ Pangab setelah selama periode tahun 1966 s/d tahun 1976 berada dibawah naungan Kementerian Transmigrasi, Veteran dan Demobilisasi dengan status PTPN “Veteran” Cabang Jawa Timur sebagai Perguruan Tinggi Kedinasan. Selanjutnya periode 1983-1994 status pembinaan langsung dibawah binaan Ditjen Persmanvet Dephankam RI, dan pada tahun 1994 sampai sekarang dibawah binaan Yayasan Kejuangan Panglima Besar Sudirman (YKPBS).
3. Tahun 1977 terjadi perubahan nama PTPN “Veteran” Cabang Jawa Timur menjadi Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Cabang Jawa Timur sebagai Perguruan Tinggi Fakultas Pertanian UPN “Veteran” Jawa Timur.
4. Setelah selama peride tahun 1966 – 1993 berada dibawah koordinasi dengan UPN “Veteran” Yogyakarta, maka pada tahun 1993/1994 telah berdiri sendiri ; dan sejak tanggal  29 Nopember 1994 Fakultas Pertanian memperoleh status swasta disamakan sebagai konsekuensi dari status PTS UPN “Veteran” Jawa Timur berdasarkan Surat Keputusan Bersama Mendikbud-Menhankam Nomor : 0307/O/1994 – Kep/10/XI/1994.
5. Periode  Nopember 1994 sampai 10 Agustus 1998, Fakultas Pertanian UPN “Veteran” Jawa Timur mem-persiapkan status akreditasi perguruan tinggi; dan berdasarkan Surat keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi No. 001/BAN-PT/Ak-1/VIII/1998 tanggal 11 Agustus 1998 telah memperoleh status terakreditasi penuh untuk semua Jurusan/ Program Studi.
6. Semenjak tahun 1998 sampai dengan saat ini status semua program studi di Fakultas Pertanian (4 Progdi yang ada) berdasarkan penilaian dari badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi semuanya telah terakreditasi dengan Nilai B.
7. Berdasarkan Sk Dirjen Dikti Nomor : 163/DIKTI/Kep/2007 Tanggal : 29 November 2007 , tentang penataan Program Studi Fakultas Pertanian, maka  Fakultas Pertanian yang semula menjadi 4 (empat) Jurusan yaitu Hama Penyakit Tanaman, Ilmu Tanah, Agronomi, dan Sosial Ekonomi Pertanian, menjadi 2 (dua) Program Studi yaitu Progdi Agroteknologi dan Agribisnis. Kedua Program Studi tersebut berdasarkan penilaian BAN-PT mulai tahun 2010 terakreditasi A.
8. Berdasarkan KEPPRES No : 62/2014 Tanggal 6 Oktober 2014 UPN “Veteran” Jawa Timur resmi menjadi Perguruan Tinggi Negeri termasuk Fakultas Pertanian.

       Fakultas Pertanian saat ini  memiliki 2 program studi jenjang S-1, yaitu Agroteknologi dan Agribisnis, 2 program studi jenjang S-2 yaitu Magister Agribisnis dan Magister Agroteknologi, serta satu program studi S-3 yaitu program Doktor Agribisnis. Tahun 2015 sudah diusulkan ke Kementerian Riset Teknologi dan Pendidikan Tinggi untuk program Master (S2) Agroteknologi dan program Doktor (S3) Ilmu Pertanian. Berkat kerja keras dalam menjaga kualitas SDM, proses manajemen dan lulusannya, program studi S-1 mendapatkan akreditasi A / unggul. Program studi S-2 Agribisnis mendapatkan akreditasi A / unggul, S-2 Agroteknologi dan S-3 Agribisnis mendapatkan akreditasi baik dari BANPT-DIKTI.